Sådan ved vi, at det startede i Wuhan

Jeg har genset beviserne fra tidlig spredning af virussen i 2019 og de første bekræftede tilfælde, og jeg er nået frem til, hvad jeg tror, ​​er det mest sandsynlige hændelsesforløb for, hvordan virussen opstod.

For at gøre en lang (agtig) historie kort ser det ud til, at virussen spredte sig globalt i anden halvdel af november 2019. Det, der var svært at forstå, var hvorfor, hvis det var i lande over hele verden den vinter, eksplosivet udbrud begyndte først i februar og marts 2020.

Når man igen ser nærmere på rapporterne om virussens fremkomst, ser det ud til, at det skyldes, at virussens rejse fra første fremkomst i efteråret 2019 til eksplosive udbrud i begyndelsen af ​​2020 foregik på en langsommere og mere forskudt måde, end vi kunne forvente af en enkel forståelse af vira. Dette skyldes ikke, at virussen ikke var til stede i lande, før den forårsagede eksplosive udbrud dér – det er den forenklede antagelse, der modsiges af dataene – men fordi virussen ikke altid forårsager eksplosive udbrud, når den er til stede.

Den nye SARS-lignende virus ser ud til først at være begyndt at inficere mennesker omkring slutningen af ​​oktober 2019. Dette var meget sandsynligt i Wuhan. Det kan antydes, at hvis virussen spredte sig globalt i november 2019, kunne den være startet hvor som helst, og det faktum, at den først blev opdaget i Wuhan, antyder intet om, hvor den startede.

Det ser dog ud til, at december-udbruddet i Wuhan, hvor det først blev opdaget, var det største til den dato. Derudover var Wuhan den følgende måned det første sted at opleve et eksplosivt udbrud, der beskattede sundhedsvæsenet, nogle uger før andre steder. Det faktum, at det var foran kurven i disse større udbrud, er en stærk indikator for, at virussen havde været der længst og oprindeligt dukkede op der.

Molekylær ur undersøgelser, som analyserer den genetiske sammensætning af tidlige tilfælde for at beregne, hvornår deres seneste fælles forfader var omkring, har en tendens til at sætte virussens fremkomst i slutningen af ​​oktober eller begyndelsen af ​​november, hvilket er i overensstemmelse med global spredning mod slutningen af ​​november. 

I Kina, en lækket regeringsrapport på tidlige tilfælde i Wuhan identificerede ni patienter indlagt i november 2019 med, hvad der senere blev bekræftet som COVID-19 (den tidligste symptomdebut var den 17. november), selvom disse aldrig er blevet tilføjet til den officielle total. EN studere hævdede også at finde nogen neutraliserende antistoffer i Wuhan-bloddonorer i september til december 2019, selvom det er uklart, hvor pålideligt dette er.

I Brasilien, opsamlede spildevandsprøver vendte positivt fra den 27. november 2019, hvilket indikerer en betydelig spredning af SARS-CoV-2 i samfundet i slutningen af ​​måneden. Interessant nok, prøver fra Italien i en separat undersøgelse blev først positiv den 18. december. Ingen spildevandspositiver er dukket op tidligere end dette nogen steder (bortset fra en unormal positiv for Barcelona i marts 2019, der antages at være en falsk positiv).

I England, Imperials REACT-undersøgelse testede omkring 150,000 mennesker for antistoffer i begyndelsen af ​​2021 og spurgte dem, der testede positive, da de huskede at have symptomer. Dette resulterede i følgende graf. 

En markant stigning i symptomatisk sygdom kan ses fra slutningen af ​​november 2019 til et stabilt niveau, der fortsætter gennem vinteren. Det eksplosive udbrud af den første bølge i slutningen af ​​februar 2020 er også tydeligt synligt. Denne graf illustrerer pænt, hvordan virussen kan cirkulere i månedsvis på et lavt niveau (tre måneder i dette tilfælde), herunder gennem vinterinfluenzasæsonen, før et eksplosivt udbrud opstår, tilsyneladende ud af det blå.

Vi har ikke gode data fra USA om tidlig spredning, da landet konsekvent har undladt at gennemføre undersøgelser af lagrede prøver af spildevand eller fra enkeltpersoner, bortset fra én Røde Kors antistof undersøgelse der fandt antistoffer i midten af ​​december 2019, men ikke kiggede på tidligere prøver eller bekræftede med testning for viralt RNA.

Ikke desto mindre har der ikke været mangel på nyhedsrapporter fra USA, der har fortalt historierne om flere personer, der blev syge med Covid-lignende sygdom i november 2019 og senere testet positive for Covid-antistoffer (når de ikke havde været syge i mellemtiden) .

Disse personer omfatter Michael Melham fra New Jersey, som rapporterer at være inficeret sammen med flere andre på en konference omkring den 21. november 2019; Uf Tukel, der rapporterer at være inficeret i Florida sammen med 10 andre i slutningen af ​​november 2019; Stephen Taylor og hans kone, smittet i Texas i november 2019; og Jim Rust, inficeret i Nebraska samme måned. Bill Rice, Jr. har samlet sammen mediehistorierne om disse tidlige antistof-bekræftede amerikanske sager. Det er bemærkelsesværdigt, at ingen af ​​dem hævder at være blevet smittet før november.

Dette vidnesbyrd om spredning i slutningen af ​​november i Kina, Brasilien, England og Amerika er, tror jeg, meget overbevisende; selv om en eller to af sagerne viser sig at tage fejl, tror jeg ikke det er sandsynligt, at de alle vil være det. De er også i overensstemmelse med estimaterne fra de førnævnte molekylære urstudier.

Disse beviser tyder på, at virussen ikke spredte sig globalt meget tidligere end dette. Dette er baseret på det negative i spildevandsundersøgelserne, de ubetydelige niveauer i Imperial-undersøgelsen, manglen på amerikanere, der melder sygdom, og fraværet af patienter i Kina. De undersøgelser, der ser ud til at vise tidligere global spredning end dette, kan skyldes krydsreaktion af antistoffer eller kontaminering af PCR-testen med høj forstørrelse.

Dette giver os mulighed for at konkludere, at virussen spredte sig på et lavt niveau rundt om i verden i slutningen af ​​november 2019, men sandsynligvis ikke meget tidligere end dette. Hvad skete der så?

Udbruddet på Huanan-markedet ser ud til at være begyndt omkring den 1. december – dette var den tidligste symptomdebut i første klynge af bekræftede Covid-patienter, der begyndte at blive indlagt den 16. december. Dette udbrud ser ud til at have været betydeligt større end andre udbrud indtil da. Den 2. januar havde 41 patienter været bekræftet som indlagt på hospitalet med en positiv Covid-test sammen med lungebetændelse og en karakteristisk CT-scanning af brystet; seks af dem døde senere.

Det var i hvert fald denne klynge af indlæggelser, der førte til påvisning af virussen ni prøver fra disse patienter blev sendt af klinikere til genomisk analyse mellem 24. december og 31. december 2019. Påvisningen af ​​virussen i det våde markedsudbrud ser derfor ud til at have været en direkte konsekvens af udbruddets sværhedsgrad – det forårsagede betydeligt flere hospitalsindlæggelser end andre udbrud indtil da og fik en række klinikere til uafhængigt at sende prøver til identifikation. Dette gjorde det dybest set uundgåeligt, at det ville blive opdaget under dette udbrud.

Når det er sagt, var udbruddet meget lille sammenlignet med de fleste af de bølger, vi har set siden 2020, og faktisk sammenlignet med, hvad der skete i Kina den følgende måned. Ser man på kurven over rapporterede Covid-dødsfald for Kina i 2020, indikerer det, at det eksplosive udbrud i regionen ikke rigtig begyndte før de første dage af januar (ved at tælle tilbage omkring 20 dage).

Dette kan forklare, hvorfor der var initial usikkerhed om, hvorvidt der var menneske-til-menneske-smitte, mens det den 14. januar blev mere og mere tydeligt, at der var som de var midt i en eksplosiv bølge for første gang. Det var sandsynligvis også erkendelsen af ​​dette eksplosive udbrud, der fik de kinesiske myndigheder til at pålægge Wuhan restriktioner fra den 23. januar.

Mærkeligt nok blev det eksplosive januar-udbrud i Hubei-provinsen ikke replikeret i andre dele af Kina, som stort set blev efterladt uberørt af virussen på dette tidspunkt. I stedet var det næste sted at se et eksplosivt udbrud Sydkorea, over en måned senere i februar, og igen var det mærkeligt nok stort set begrænset til én by, Daegu. Det var i samme omfang som Wuhan-udbruddet med et tilsvarende antal dødsfald.

Dernæst var det turen til Italiensk vin og Iran til at opleve eksplosive udbrud, der begynder i midten af ​​februar. Udbruddet i Italien var stadig hovedsagelig begrænset til én del af landet, selvom omfanget af det var ud over noget, der endnu var set, og det iranske udbrud var af en lignende størrelse. Derefter fulgte New York og det nordøstlige USA, og også England, Frankrig og store dele af Vesteuropa (dog ikke Østeuropa eller meget af resten af ​​USA). Alle disse udbrud var meget tættere på til den større italienske skala end den kinesiske og sydkoreanske skala. Andre steder fortsatte med lav niveauspredning, indtil de havde deres første eksplosive bølger senere i 2020, eller i nogle tilfælde i 2021 eller endda 2022.

Det, der slår mig ved dette, er, hvordan omfanget og omfanget af udbruddene steg trinvist mellem november 2019 og februar 2020. Spredningen i november 2019 var global, men lavt niveau. I december tog udbruddet af Wuhan våde marked tingene et trin op, hvilket resulterede i et højere antal hospitalsindlæggelser og dermed påvisning af virussen. Så i januar oplevede Wuhan det første eksplosive Covid-udbrud og bølge af dødsfald. Og i februar begyndte de store europæiske og amerikanske bølger, der øgede skalaen yderligere flere hak, hvor den stort set forblev. (Da det kom til Omicron i slutningen af ​​2021, øgede omfanget af udbrud yderligere, men reducerede dødeligheden betydeligt.)

Dette giver, tror jeg, et præcist billede af, hvordan virussen opstod – via en trinvis bevægelse i retning af større og større udbrud fra en uheldig start med lav spredning i november. Denne bevægelse er, formoder jeg, et resultat af genetiske ændringer i virussen, som ændrer dens overførbarhed i forskellige populationer og sammenhænge – en hypotese, der er i tråd med konklusionerne af molekylære urstudier.

Vi kan derfor, tror jeg, være rimelig sikre på, at virussen først dukkede op i Wuhan i efteråret 2019 og ikke først først blev opdaget der, da Wuhan var den første til at opleve de større udbrud i både december og januar, hvilket tyder på, at virussen havde været der. den længste.

Gentrykt fra DailySceptic